工藤新一是霓虹有名的高中生侦探，他的父亲是拿过奥斯卡的编剧加推理小说家，母亲是曾经的娱乐圈顶流女演员，而他自己也怀揣着想要成为侦探的梦想，年纪轻轻就已经被大家称为霓虹警察的救世主。

     就这样原本应该是意气风发，有着光明未来的青年，如今却变成了小学一年级的小学生，靠着谎言寄住在青梅竹马的毛利兰家里。

     而这一切的罪魁祸首，就是他们——穿着黑色衣服的男人！ 那天在游乐园，先是经历了被吓晕的法术攻击，又遭受到当头一棍的物理伤害，最后还被人用药想要彻底杀人灭口完成补刀。

     原本以为真的会死在那里，然而走马灯才播放到一半，他就彻底失去了直觉。

     醒过来后，全身上下都退回到了六七岁的时候。

     这样匪夷所思的事情告诉谁都不会相信，而且在那些危险分子的眼中自己已经是死人了，为了保护周围人的安全，工藤新一化名为江户川柯南，目前只有邻居的阿笠博士知道自己的身份。

     变成小学生后，他重新回到了他的母校，帝丹小学就读一年级。

     虽然不知道前方面临的是什么，但日子还得继续过下去，他也没有一刻放弃追查那些家伙的行踪，想要变回正常的自己。

     今天他跟着毛利兰的爸爸毛利小五郎，三个人一起乘搭新干线，前往京都去体验温泉旅馆。

     那间旅馆是曾经毛利小五郎的同学开办的，现在刚刚返修完毕。

     在车上现在正好是午饭时间，他们三个人便来了电车内的餐厅，准备吃个午饭。

     刚一进门，江户川柯南就听见了一个特别耳熟的声音，这个声音他一辈子都不会忘记！ 在经过确认后，发现是那天在游乐园中袭击了自己的三个男人！ 真的！终于找到你们了！ 毛利兰他们已经选好了座位，江户川柯南因为是小孩子，完全没有话语权，他的位置是背对着那三个男人，想要看他们在做什么就得转过头，这样太显眼了。

     可恶！有没有什么办法是能知道他们在说什么的........ 江户川柯南相信这样一群危险的家伙出现在新干线上肯定不可能是单纯的出行，他们肯定在计划着什么邪恶的计划！ 他见毛利大叔和兰姐姐正在点菜的时候，抓准时机溜出了座位。

     “柯南君！你去哪里啊？”毛利兰发现，在后面大声问道。

     “厕所厕所！” 无奈，江